社保二档和三档的区别如下：
1、缴费不同：
二档：缴费基数为上年度在岗职工月平均工资，缴费比例为0.8%，其中公司缴纳0.6%，个人缴纳0.2%；
三档：缴费基数为上年度在岗职工月平均工资，缴费比例为0.55%，其中公司缴纳0.45%，个人缴纳0.1%。
2、住院方面不同：
二档：住院报90%，需在定点医院办理住院；
三档：一级医院报85%，二级医院报80%，三级医院报75%，同时需绑定社康医院。可通过绑定医院开转诊单，可到绑定医院的上一级医院看病。
注：没有开转诊单直接到想住院的医院办理报销比率下降10%，以第三档三级医院为例，最只能报销67.5%
3、就医原则不同：
二档参保人：门诊在绑定中心就医，住院在市内任一定点医疗机构就医，门诊大病在规定医疗机构就医；
三档参保人：门诊在绑定中心就医，住院及门诊大病在规定医疗机构就医。
法律依据：《中华人民共和国社会保险法全文》第六十四条
社会保险基金包括基本养老保险基金、基本医疗保险基金、工伤保险基金、失业保险基金和生育保险基金。除基本医疗保险基金与生育保险基金合并建账及核算外，其他各项社会保险基金按照社会保险险种分别建账，分账核算。社会保险基金执行国家统一的会计制度。
社会保险基金专款专用，任何组织和个人不得侵占或者挪用。
基本养老保险基金逐步实行全国统筹，其他社会保险基金逐步实行省级统筹，具体时间、步骤由国务院规定。
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